省局技术中心内设四个中心：综合管理中心、农产品检测中心、工业品检测中心及仪器分析中心。
    综合管理中心：负责中心办公行政、文秘档案、人力资源、计划财务管理；负责中心内部及全省检验检疫实验室相关检测业务的管理与协调；负责中心业务接受、报告发送、样品管理等业务；负责技术中心质量体系运行的管理；负责制定实验室技术培训、技术指导、能力验证计划并组织实施；负责中心后勤保障和检测业务市场开拓等。内设四个科：综合管理科，业务管理与开发科，质量保证科，财务管理科。其职责由该中心划定。
    农产品检测中心：负责农产品检验检疫的实验室检测和对全省相关实验室的技术指导工作等。内设五个科：微生物科，理化分析科，植物检疫科，动物检疫科、生物毒素科。其职责由该中心划定。
    工业品检测中心：负责包括轻纺、机电、金属材料、危险品及包装等工业产品及原材料的检测和对全省相关实验室的技术指导工作等。内设六个科：机电金属材料检测科、纺织原料检测科、纺织品检测科、轻工产品检测科、危险品及包装检测科、橡塑及制品检测科。其职责由该中心划定。
    仪器分析中心：负责需要使用共用大型仪器进行检测的所有项目和化矿产品的检测及相关技术的研究开发与指导等。内设四个科：气相及气质分析科、液相及液质分析科、光谱分析科、化学分析科。其职责由该中心划定。